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Thème 2 : la taxinomie 1 : Chapitre 1 : Définitions et compréhensions

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Thème 2 : la taxinomie 1 : Chapitre 1 : Définitions et compréhensions

Message par William-Murdoch le Sam 4 Nov - 17:36

Thème 2 : la taxinomie 1 : Chapitre 1 : Définitions et compréhensions

La taxonomie, ou taxinomie, est une branche de la biologie, qui a pour objet de décrire les organismes vivants et de les regrouper en entités appelées taxons afin de les identifier puis les nommer et enfin les classer et de les reconnaitre via des clés de détermination dichotomiques. Elle complète la systématique qui est la science qui organise le classement des taxons et leurs relations. Parmi ces méthodes, les plus récentes incluent une nouvelle approche conceptuelle de la classification mais aussi des méthodes d'analyse d'éléments empiriques restés longtemps ignorés de la science avant l'arrivée, au cours de la seconde moitié du XXe siècle, des découvertes de la biologie moléculaire.

La taxinomie s'étend maintenant à d'autres sciences, entre autres les sciences humaines et sociales, les sciences de l'information ou l'informatique.

Le naturaliste suédois Carl von Linné (1707-1778) posa les fondations de la systématique, et fut l'auteur d'une classification dont les grands principes furent la base de la systématique scientifique jusqu'au milieu du XXe siècle.

Près de trois millions d'espèces d'êtres vivants ont été décrites à ce jour et ce nombre ne cesse de
grandir. En région équatoriale, des pans entiers de la biodiversité, particulièrement dans certains
groupes comme les insectes ou les champignons ou -a fortiori- les microorganismes, n'ont pas
encore été décrits et, selon certaines estimations, le nombre réel d'espèces existant actuellement
sur Terre pourrait dépasser 30 millions. Une mission importante de la biologie est de décrire et d’inventorier la biodiversité.

La systématique est le domaine de la biologie qui s'occupe d'inventorier et de classer cette
extraordinaire diversité de formes vivantes en un système structuré et logique. Ce système de classification est hiérarchisé.

Le niveau le plus fondamental de ce système est celui de l'espèce. Dans le cadre de ce cours, retenons-en une définition simplifiée. Une espèce est constituée d'un ensemble d'organismes très semblables entre eux, en principe potentiellement interféconds, et descendant d'un ancêtre unique. La démarche qui permet de "mesurer" le degré de ressemblance entre des organismes vivants, et donc de les regrouper en espèces, est complexe.

Un groupe d'espèces ressemblantes constituent un genre. La notion de genre remonte à Bauhin
(1560-1624). Elle constitue une avancée importante, puisqu'elle ouvre la voie aux système
s de classifications hiérarchisés actuels. Linné (1707-1778) invente la nomenclature binomiale. Dans ce système, le nom de chaque plante comporte deux mots: un substantif, qui indique le genre, et une épithète, qui indique l'espèce.

Ex.: L'ail se nomme Allium sativum. Dans le genre Allium, on range également le poireau (Allium
porrum), l'oignon (Allium cepa), l'échalote (Allium ascalonicum) et la ciboulette (Allium
schoenoprasum). L'appartenance à un même genre implique que toutes ces espèces ont un
ancêtre commun qui appartenait lui-même au genre Allium.

Les genres sont regroupés en familles, les familles en ordres, les ordres en classes, les classes en
embranchements, et les embranchements en règnes.

Comparons : Homme et Poireau

Pour l'homme :
Règne : Animalia (Animaux)
Phylum (Embranchement) : Chordata (Cordés)
Classe : Mammalia (Mammifères)
Ordre : Primates
Famille : Hominidae (Hominidés)
Genre : Homo (Homme)
Espèce : sapiens (Homme moderne)

Pour le poireau :
Règne : Plantae (Plantes)
Phylum : Angiospermophyta (Angiospermes)
Classe : Liliidae
Ordre : Liliales
Famille : Alliaceae (Alliacées)
Genre : Allium (Ail)
Espèce : porrum (Poireau)

Note 1: le nom de tous les niveaux commence par une majuscule, sauf le nom d'espèce qui est toujours écrit avec une minuscule.

Note 2: on peut utiliser indifféremment la terminologie latine ou son équivalent français.

Nommer et classer les organismes vivants est une préoccupation ancienne. En ce qui concerne les
plantes, les travaux les plus anciens sont ceux des Grecs. Théophraste (env. 300 av. J.-C.), élève de
Platon et d'Aristote, distinguait déjà les plantes à fleurs et les plantes sans fleurs; il décrivit environ
500 espèces de plantes. L'ouvrage le plus important de l'Antiquité est le Materia Medica
de Dioscoride (1er siècle après J.-C.), qui décrit 600 espèces de plantes et indique leur valeur thérapeutique. Il a été la plus importante source en la matière jusqu'au Moyen Age.


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